儀器準備與啟動：首先，確保毛細管電泳儀處于正常工作狀態(tài)，檢查所有外部連接是否牢固。然后，打開電泳儀的電源開關(guān)，等待一段時間以確保儀器達到穩(wěn)定工作溫度。啟動電泳儀上的控制軟件，并連接電泳儀與電腦。

樣品處理：準備待測樣品，并標記好每個樣品的相關(guān)信息，如樣品編號、濃度等。根據(jù)樣品特性選擇適當?shù)念A處理方法，如蛋白質(zhì)樣品可能需要進行還原、熱變性等處理。

樣品注射：取一根膠管，一端插入裝有待測樣品的樣品瓶中，另一端插入電泳儀的樣品槽中。打開電泳儀軟件上的樣品注射選項，設(shè)置注射時間和注射電壓。確保膠管中沒有氣泡，控制好注射速度，使樣品緩慢注入到毛細管中。

電泳：設(shè)置所需的電泳參數(shù)，包括電壓、電流、電泳溫度等。在電泳儀軟件上選擇相應(yīng)的電泳方法，并輸入相關(guān)參數(shù)。點擊開始電泳按鈕，啟動電泳過程。電泳過程中，由于管壁硅羥基的存在會產(chǎn)生電滲流，電滲流將推動整個毛細管柱內(nèi)的溶液定向移動，從而根據(jù)樣品中各組分的淌度（單位電場強度下的遷移速度）和分配行為的差異實現(xiàn)各組分的分離。

數(shù)據(jù)記錄與分析：在電泳完成后，電泳儀將收集并記錄相關(guān)數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)可以通過軟件進行進一步的分析和處理，以獲取樣品的詳細信息。